Charles Darwin`in evrim teorisi, yüzyılı aşkın süredir bilim insanları nazarında genel geçer bir doğru olarak kabul ediliyor. Peki, gerçekten öyle mi? Her ne kadar bu teori yerleşik bir hal alana kadar uzun bir süreci geride bırakmış olsa da Darwin`in Kara Kutusu`nda biyokimyacı Michael J. Behe bu kabulü kökten sarsacak bulguları masaya yatırıyor. Modern biyokimya, hücrenin kara kutusunu açtığında karşımıza çıkan manzara basit bir yapıdan ibaret değil. Görme, kan pıhtılaşması ve hücresel taşıma gibi süreçleri yöneten, ince ayarlı ve birbirine bağımlı sistemlerden oluşan muazzam bir karmaşa. Behe, "indirgenemez karmaşıklık" adını verdiği bu sistemlerin, Darwin`in öngördüğü gibi küçük, kademeli ve rastgele mutasyonlarla oluşamayacağını bizzat bilimin güncel verilerine dayanarak okura sunuyor. Yaşamın moleküler temelinde "akıllı bir tasarımın" yattığını savunuyor. Darwin`in Kara Kutusu, bilimsel literatürü inceliyor ve yaşamın temelindeki bu zarafet karşısında tıkanıp kalan literatürün, bu konudaki sessizliğini gözler önüne seriyor.