Dr. Eggman şimdiye kadar ki en uç planını uygulamaya kondu ve Sonic şimdiden ona yetişmek için yarışıyor! Dr. Eggman tüm şehirleri metal virüsüne boğarak Zombot yığınları yaratırken Sonic`in kendisi de enfeksiyonunu kontrol altında tutmak için mücadele ediyor! Ve Sonic`in arkadaşları kurban olmaya başladığında artık hiç kimsenin güvende olmadığı gayet açık!
Sonic, kriz içindeki şehri kurtarabilecek mi... yoksa sonunda dengiyle mi karşılaştı?