Temel Felsefe: "Kendini bilen, Rabbini bilir." İbrahim Hakkı’ya göre insan bedeni, Allah’ın sanatının sergilendiği en mükemmel aynadır.
1. Mikrokozmos Olarak İnsan
Ona göre insan bedeni, kâinatın bir özetidir (Zübde-i Âlem). Yıldızların ve elementlerin evrendeki düzeni neyse, insan bedenindeki organların işleyişi de odur.
2. Sistematik Anlatım
İbrahim Hakkı, anatomiyi sadece ruhani değil, biyolojik bir titizlikle ele alır:
•    Kemik Yapısı: İskelet sistemini, eklemleri ve kafatasını sayısal verilerle açıklar.
•    Organların Fonksiyonu: Kalbi hükümdara, mideyi mutfağa, beyni ise bir yönetim merkezine benzeterek işlevlerini anlatır.
•    Sinir ve Damar Sistemi: Vücuttaki kan dolaşımı ve sinir ağlarını dönemin tıp bilgisiyle harmanlar.
 Fizyonomi (Kıyafetname) Bağlantısı
Anatomi bilgisini Kıyafetname bölümüyle taçlandırır. Dış görünüşten (göz rengi, el yapısı, boy pos) yola çıkarak kişinin karakter tahlilini yapar. Bu, anatomik yapının ruhsal yapı üzerindeki yansımasıdır.
Neden Önemli?
•    Tıbbi bilgiyi tasavvufi bir derinlikle birleştirmiştir.
•    Bedenin her parçasının bir hikmetle yaratıldığını ispat ederek, anatomi öğrenmeyi ibadet derecesinde önemli görmüştür.
Özet: "Bu beden, ruhun bineğidir; onu tanımak, yaratıcıyı tanımaya açılan kapıdır."